红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析

作者：刘湘楠; 胡祥祥; 乔梦燚; 周丹宁; 朱畇昊^*

来源：江苏农业科学, 2023, 1-9.

• 红花
• Aux/IAA基因家族
• 生物信息学分析
• 盐胁迫

Aux/lAA基因家族是生长素早期应答的关键基因之一。本文旨在对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析,为研究该基因在红花生长发育中的调控作用奠定基础。本研究利用生物信息学方法,在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,使用MEGA7.0做出系统发育进化树。经理化性质分析,红花Aux/IAA蛋白为亲水性蛋白,且80%位于细胞核中,大多数红花Aux/IAA蛋白表现为偏酸性,在其二级结构中,无规则卷曲所占比例最大,β-转角所占比例最小;经聚类分析,将红花Aux/IAA基因其分为5个亚族。基因结构分析表明,所有基因均含有1～9个内含子。这些基因在红花的9条染色体上非均匀地分布,其中第9条染色体上分布最多,有7个Aux/IAA基因。红花Aux/IAA基因在不同发育期及不同外源激素处理表达量各不相同。对保守基序分析作图发现,大部分红花Aux/IAA蛋白具有4个共同的保守基序,分别为motif 1、motif 2、motif 3、motif 4,qRTPCR结果表明,不同浓度盐胁迫处理24 h后,基因CtAux/IAA1相对表达量呈上调趋势,推测此基因可能与提高红花抗盐胁迫能力有关。本研究将有助于了解红花Aux/IAA基因家族在生长发育过程中的功能并筛选优良基因。

• 单位
  河南中医药大学