应用基因本体数据库分析中波紫外线对HaCaT细胞microRNA表达的影响

作者：杨玲; 许速; 胡中华^*

来源：实用皮肤病学杂志, 2018, 11(06): 329-336.

• 中波紫外线
• 人永生化角质形成细胞
• 微小RNA
• 基因本体

目的应用基因本体(GO)数据库分析中波紫外线(UVB)对人永生化角质形成细胞(Ha Ca T细胞)micro RNA(mi RNA)表达的影响。方法 Ha Ca T细胞根据UVB强度(100m J/cm2、200 mJ/cm2、400 mJ/cm2)及辐照时间(12～24 h)的不同组合,完成7张mi RNA芯片[(对照、100 mJ/cm2(12 h)、100 mJ/cm2(24 h)、 200 mJ/cm2(12 h)、200 mJ/cm2(24 h)、400 mJ/cm2(12 h)、400 mJ/cm2(24 h)]的制作及扫描,筛选差异表达的mi RNAs,采用Target Scan进行靶基因预测,并对其进行基于GO数据库的功能富集分析。结果不同强度UVB辐照HaCaT细胞后均出现差异miRNA表达,其中400 mJ/cm2 UVB处理组的miRNA差异表达最为明显,根据差异倍数(fc)筛选9个miRNAs拟进行后续实验研究,分别为上调表达的miR-8063、miR-1273f、miR-4497、miR-4778-5p、miR-6510-5p和下调表达的miR-1973、miR-5100、miR-205-3p、miR-4485-3p。靶基因预测及GO富集分析发现部分靶基因功能涉及T淋巴细胞介导的细胞毒作用、T淋巴细胞耐受、B淋巴细胞分化、自然杀伤细胞增生、树突细胞抗原处理提呈、免疫球蛋白产生以及中性粒细胞稳态等方面。结论 UVB作用HaCaT细胞后存在差异表达miRNAs,其靶基因功能与体液免疫和细胞免疫相关。