利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性

作者：张君毅^*; 吴永辉; 刘嘉; 秦建立; 张轶钧

来源：植物生理学报, 2020, 56(04): 743-751.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2020.0039

• 铁皮石斛
• TRAP标记
• 抗寒性
• 遗传多样性
• SCAR标记

开发目标区域扩增多态性(TRAP)和特异序列扩增区域(SCAR)标记,对铁皮石斛(Dendrobium officinale)的3个生态类群46份种质进行遗传多样性评价、野生群体鉴别以及抗寒性筛选。以抗寒相关的CBF1/DREB1转录因子和钙依赖型蛋白激酶(CDPK1)基因设计TRAP固定引物,从57对TRAP引物中共筛选出21个引物组合,多态信息量(PIC)、分辨率(RP)和多态带百分比(PPB)平均分别为0.899、2.054和76.79%。Nei氏基因多样度(H)为0.217 7～0.291 7 (平均为0.258 1), Shannon信息指数(I)为0.325 1～0.442 1 (平均为0.389 2)。野生类群遗传多样性水平最高,仿野生类群和栽培类群基本一致。主成分分析(PCA)结果表明供试材料可分为野生和栽培两大类群。此外,开发了一个铁皮石斛转录因子(RAP2-4)的SCAR标记,并以该SCAR标记和TRAP固定引物共同筛选出了核心抗寒种质资源。本文研究策略拟为TRAP标记在育种中的应用提供参考。

• 单位
  华侨大学