摘要

为研究硅酸钠增强马铃薯黑痣病抗性的分子机制,将硅酸钠诱导马铃薯黑痣病转录组中表达量较高的基因StZFP2进行克隆和生物信息学分析。锌指蛋白(Zinc-finger protein, ZFP)是真核生物中重要的转录因子之一,其通过与核内其它因子相互作用,参与植物的生物与非生物胁迫反应。为了得到StZFP2及分析其表达蛋白的性质,本研究采用RT-PCR方法克隆StZFP2,并使用在线网站对其进行生物信息学的全面分析。结果表明,StZFP2共含有618个碱基对,其开放阅读框以ATG为起始密码子,以TGA为终止密码子,含有498个碱基对,预测蛋白含165个氨基酸。预测StZFP2蛋白是碱性、亲水性和非跨膜蛋白,亚细胞定位预测显示StZFP2主要位于细胞核内。通过系统进化分析和蛋白多重序列比对,马铃薯与番茄、辣椒、烟草和牵牛花等植物的ZFP同源性较高。组织特异性表达分析结果显示StZFP2基因在马铃薯不同组织中存在明显的组织表达特异性,在叶片中表达量最高,在根中表达量最低。以上对于StZFP2在马铃薯中的初步分析将为后续利用基因工程手段揭示硅酸钠提高马铃薯抗黑痣病能力的分子机制提供依据。