血满草叶绿体基因组结构与特征分析

作者：李幸儿; 赵艳; 李雪; 任玉玲; 李萍^*

来源：种子, 2023, 42(04): 1-9.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2023.04.001

• 血满草
• 叶绿体基因组
• SSR位点
• 密码子偏好性

为研究血满草叶绿体基因组结构与特征，以血满草新鲜叶片为材料，提取叶绿体DNA,对叶绿体基因组进行测序、组装，并对其大小、结构、基因组成、简单重复序列(SSR)位点、密码子偏好性以及系统发育进行分析。结果表明，血满草叶绿体基因组长度为158 610 bp,包括大单拷贝区(LSC, 87 345 bp),小单拷贝区(SSC, 18 937 bp)以及两个反向重复序列(IRa和IRb, 26 164 bp),总G+C含量为37.61%;血满草叶绿体基因组共编码到131个基因，包括86个蛋白编码基因，37个转运RNA基因，8个核糖体RNA基因。序列鉴定共发现6种类型的SSR,包括4种单核苷酸、2种二核苷酸；17个基因包含1个或2个内含子，其中11个位于蛋白质编码基因中，6个位于tRNA基因中；86个蛋白编码基因包含80 364 bp,编码26 788个密码子；系统发育分析显示，血满草与接骨木有较近的亲缘关系。