太子参蚕豆萎蔫病毒2号CP基因的遗传多样性及分子进化分析

作者：匡云波; 叶炜; 李金辉; 于静静; 叶祖云

来源：植物病理学报, 2017, 47(04): 470-478.

DOI：10.13926/j.cnki.apps.000095

• 太子参
• 蚕豆萎蔫病毒2
• CP
• 遗传多样性
• 分子进化

为了解太子参蚕豆萎蔫病毒2(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)的遗传多样性及分子进化关系,本研究对5个不同地理来源的6份太子参病叶样品进行了BBWV2外壳蛋白(coat protein,CP)基因的RT-PCR扩增和克隆。序列分析结果表明,所得13条太子参BBWV2 CP基因序列均为1 345 bp,其核苷酸序列同一性在81.0%99.0%之间,氨基酸序列同一性在93.5%99.3%之间;核苷酸多样性为0.084 00;存在280个核苷酸多态性位点,其中232个为地域特异性位点;总变异数为278个,其中同义突变29个,异义突变249个。不同地理来源的太子参BBWV2分离物之间遗传分化程度较高,基因交流不频繁,遗传漂变可能导致分离物间明显的遗传分化。在系统进化树中,太子参分离物的聚类呈现出明显的地域特异性,江苏、贵州、湖南、福建分离物均聚类在I-a亚组,而山东分离物聚类在II-c亚组,遗传距离较远。研究表明,太子参BBW V2存在很高的遗传变异,基因突变是其产生遗传多样性的主要驱动力,而地理因素与其具有较高的核苷酸多样性密切相关。

• 单位
  三明市农业科学研究院; 宁德师范学院