羊口疮病毒强弱毒株免疫相关基因的比较分析

作者：张艳敏; 丁学东; 马园; 张静; 吉鹏华; 王国华; 潘相臣; 刘冬冬; 田普厚; 石顺利; 张七斤^*

来源：畜牧与饲料科学, 2020, 41(05): 96-106.

• ORFV
• 免疫相关基因
• 系统进化树
• 同源性分析

通过对采集到的青岛市某发病羊场羊口疮病料(强毒)在山羊成纤维细胞上连续传90代(弱毒)后,分别进行病毒基因组提取,并对提取到的基因组分别命名为ORFV-QD和ORFV-RD。根据GenBank上发表的ORFV全基因组序列设计并合成3对特异性引物,分别扩增ORFV-QD和ORFVRD的B2L基因、F1L基因和VIR基因片段,并将扩增得到的基因组片段分别克隆到pMD-19T载体上,转化到DH5α感受态细胞中,对重组质粒进行鉴定后送至测序公司进行测序,用DNASTAR软件对测序结果进行拼接及3组基因之间核苷酸同源性比较分析,将测序结果与NCBI上已公布的13组ORFV全基因组相应基因核苷酸序列进行同源性比对分析、构建系统进化树及氨基酸序列比对分析。结果表明,3组基因与参考序列的B2L基因、F1L基因和VIR基因核苷酸同源性分别为92.1%～98.4%、96.1%～99.1%和94.6%～100%。将2株病毒基因组与参考序列进行氨基酸序列比较分析,结果显示2株病毒基因组之间并没有较为明显的差异。

• 单位
  内蒙古农业大学; 内蒙古自治区农牧业科学院