两种肺动脉高压模型小鼠的基因表达谱分析

作者：邢书娟; 董明清^*; 杨力侠; 罗颖^*

来源：基础医学与临床, 2020, 40(11): 1462-1467.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2020.11.005

• 肺动脉高压
• 基因芯片
• 生物信息学分析
• 差异表达基因

目的利用芯片技术和生物信息学分析方法挖掘肺动脉高压(PAH)关键基因,探讨PAH的发生机制。方法用自测数据-低氧性PAH小鼠差异表达矩阵和NCBI数据库下载的小鼠PAH表达谱芯片数据(GSE48936);联合分析这两组数据。结果 1)得到共同差异表达基因112个;2)GO结果表明这些基因主要富集在炎性反应、防御反应、刺激反应等生物学过程;3)KEGG分析发现这些基因主要参与趋化因子信号途径、细胞因子与其受体相互作用、细胞色素p450对外源物质代谢的影响等通路;4)利用于String数据库对这112个基因分析,筛选出10个degree得分较高的中心基因CD68、CD86、CCL6、ms4a6d、CXCL10、C3ar1、CXCL9、C1qA、C1qB、Ctss;将这些基因利用Cytoscape软件进行模块分析,筛选出3个显著模块,显著模块涉及基因主要富集在炎性反应、IL-17、白细胞迁移正调控和防御反应的调节等信号通路。结论这些基因可能与PAH发生发展密切相关,为PAH发病的分子机制提供一定参考。

• 单位
  中国人民解放军空军军医大学; 西安外事学院