四川蜘蛛抱蛋的转录组分析及其甾体皂苷合成相关基因的挖掘

作者：高萌; 陈婷婷; 周浩; 王君瑞; 高乞^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-13.

• 四川蜘蛛抱蛋
• 转录组
• 甾体皂苷
• SSR分子标记
• 基因筛选

四川蜘蛛抱蛋既可供庭院观赏又可民间药用。本研究通过Illumina MGI 2000平台对四川蜘蛛抱蛋的茎、叶、花进行转录组测序和生物信息学相关分析。结果表明：转录组测序共获得clean data 5.26 Gb，Q30碱基为91.11%，组装后得到60 091条Unigene，平均长度718.7 bp，N50长度为1220 bp。Unigene在NR、Swiss-Prot、COG、KOG、GO、KEGG六个数据库中分别注释到29 070条、21 524条、11 977条、26 399条、9 140条、9 230条，总体注释率为50.27%。其中，注释到的Unigene在GO库中可分为生物学过程、细胞组分、分子功能三大类共43小类；在KEGG库中，分为7大类40小类。KEGG 代谢通路分析发现有136条Unigene参与编码甾体皂苷类化合物生物合成途径中关键酶，几乎涵盖了甾体皂苷生物合成的整个途径。此外，鉴定到SSR位点16239个，其中单核苷酸重复最多，占SSR位点总数47.74%。本研究结果为四川蜘蛛抱蛋甾体皂苷类化合物的开发和利用提供科学依据，同时为后续用于蜘蛛抱蛋属植物的种质鉴定、遗传多样性以及重建系统发育关系的分子标记开发提供数据支持。

• 单位
  广西民族大学