宏基因二代测序在腹膜透析相关腹膜炎病原学诊断中的应用

作者：张庆燕; 金波; 冯媛; 钱凯; 王华; 万骋; 徐鹏飞; 张苗; 蒋春明^*

来源：中华肝脏病杂志, 2023, 39(01).

• 腹膜透析
• 腹膜炎
• 诊断
• 宏基因二代测序
• 病原学

目的探讨宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)在腹膜透析(peritoneal dialysis, PD)相关腹膜炎病原学诊断中的价值。方法该研究为回顾性队列研究。分析2020年6月至2021年7月在南京大学医学院附属鼓楼医院就诊并同时留取PD流出液样本行病原体mNGS检测和微生物培养的PD相关腹膜炎患者的临床资料, 比较mNGS检测和传统微生物培养对PD相关腹膜炎病原学诊断的阳性率、时效性和一致性。结果共18例PD相关腹膜炎患者纳入本研究, 其中男性11例, 女性7例, 年龄(50.4±15.4)岁, 中位透析龄34.0(12.4, 62.0)个月。mNGS检测共有17例患者检出致病菌, 阳性率为17/18, 高于微生物培养的13/18, 但差异无统计学意义(P=0.219)。两种检测方法均阳性的患者有12例, 其中11例患者检出的致病菌一致;5例微生物培养阴性患者的mNGS检测为阳性, 包括表皮葡萄球菌3例(1例同时检出表皮葡萄球菌和人葡萄球菌)、结核分枝杆菌1例及解脲脲原体1例;1例患者微生物培养阳性(大肠埃希菌)而mNGS检测阴性。mNGS检测报告时间显著低于微生物培养[25.0(24.0, 27.0)h比89.0(72.8, 122.0)h, Z=3.726, P < 0.001]。结论 mNGS对PD相关腹膜炎的病原体检测敏感性高, 检出致病菌与微生物培养具有较好的一致性, 并缩短了检出时间, 可能成为PD相关腹膜炎特别是难治性腹膜炎病原体识别的新途径。

• 单位
  南京大学医学院附属鼓楼医院