贵州6个地方鸡FSHβ基因多态性及生物信息学分析

作者：王天松; 黄明捷; 郭勇; 莫先艇; 陆静; 张勇^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2020, (09): 15-168.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2019.07.0270

• FSHβ基因
• 单核苷酸多态性
• 生物信息学
• 地方鸡种
• 遗传多样性
• 分子育种

为了研究促卵泡素β亚基(follicle stimulating hormone, FSHβ)基因在贵州6个地方鸡种中的多态性并进行FSHβ基因生物信息学分析,试验以矮脚鸡、白宜黑鸡、乌蒙凤鸡、高脚鸡、威宁鸡、竹乡鸡为研究对象,分别构建DNA混池,用PCR产物直接测序法检测FSHβ基因多态性,对FSHβ蛋白二级结构、三级结构及基本性质进行生物信息学分析。结果表明:矮脚鸡、白宜黑鸡、乌蒙凤鸡、高脚鸡、威宁鸡和竹乡鸡分别有11,6,7,6,6,3个SNP位点。FSHβ蛋白不稳定且为分泌蛋白,含有信号肽序列,但不是跨膜蛋白。亚细胞定位在分泌通路S上,有一个卷曲螺旋结构(置信值低)和疏水区域,保守结构域在17～123位氨基酸之间。说明贵州6个地方鸡种FSHβ基因具有较高的遗传多样性。

• 单位
  贵州大学; 动物科学学院