高同型半胱氨酸血症导致大鼠海马基因表达谱变化

作者:潘建青; 李巷; 杨志刚; 杨少敏; 张玲玲; 江山; 杨春水*
来源:神经损伤与功能重建, 2020, 15(02): 75-122.
DOI:10.16780/j.cnki.sjssgncj.2020.02.003

摘要

目的:观察高同型半胱氨酸(HCY)对大鼠海马基因表达谱的影响。方法:10只雄性SD大鼠随机分为对照组和高HCY组。高HCY组大鼠皮下注射L-HCY(60μg/g),2次/日,连续注射14 d;对照组注射等量生理盐水。造模完成后取血浆分析HCY水平;提取海马组织RNA采用BGISEQ-500技术进行测序。测序数据通过主成分分析进行样本间的比较,找出并剔除离群样品,DEGseq方法分析组间差异表达基因。根据KEGG注释结果以及官方分类,将差异基因进行生物通路分类和富集分析。结果:高HCY组大鼠血HCY明显高于对照组(P<0.01)。大鼠海马RNA测序数据使用DEGseq总共筛选到34个有显著性差异表达的mRNA,生物通路分类和富集分析找到最主要的通路是神经活动配体-受体相互作用通路。结论:高HCY血症导致大鼠海马的基因表达谱改变,影响神经活动配体-受体相互作用等生物通路。

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