胃癌中miRNA-340的体内外增殖能力检测及生物信息分析

作者：王健; 陈文静; 林慧娟; 张江宇^*

来源：南方医科大学学报, 2019, 39(07): 784-790.

DOI：10.12122/j.issn.1673-4254.2019.07.06

• 胃癌
• miRNA-340
• circRNA
• 信号通路
• 生物信息

目的了解miRNA-340在胃癌发生中的可能机制,在线预测与其相互作用的circRNAs及其下游靶基因和参与的信号通路。方法利用芯片筛选胃癌细胞株中差异表达miRNA;利用Real-time RT-PCR,检测miRNA-340在21对胃癌组织与癌旁正常组织中的表达水平;利用MTT及EdU细胞增殖实验,检测miRNA-340对正常胃上皮细胞HFE145与胃癌细胞BGC-823的体外增殖能力;利用裸鼠成瘤实验检测miRNA-340在体内成瘤的能力。随后,通过在线软件Targetscan、David数据库及Starbase分别对miRNA-340的下游的靶基因、相关信号通路及相互作用的circRNAs进行生物信息分析。结果与正常胃上皮细胞HFE145相比较,miRNA-340在胃癌细胞株中的表达水平显著下调;Real-time RT-PCR结果显示,miRNA-340在胃癌组织中的表达明显低于正常粘膜组织(P<0.048);体内体外实验表明miRNA-340对细胞的体外增殖能力具有一定的抑制作用;生物信息分析显示,预测的miRNA-340相互作用的下游靶基因中,筛选出21个具有3个及以上的保守结合部位的靶基因,其中多个靶基因均参与肿瘤的发生及侵袭;相互作用的circRNAs中筛选出分值前10个circRNAs作为与miRNA-340可能作用最强的sponge circRNAs。结论 miRNA-340在肿瘤发生发展中可能起到了抑癌基因的作用,对胃癌细胞的增殖具有一定的抑制作用;miRNA-340与多个circRNAs可能存在相互作用,共同调控下游靶基因参与胃癌的发生发展。

• 单位
  广州医科大学