高通量测序技术解析中学校园细菌群落的特征组成

作者：黄婷; 方源; 冯舟; 沈和; 聂勇; 郑鑫; 汪家权^*; 许子牧^*

来源：生物技术通报, 2020, 36(08): 96-103.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2020-0134

• 校园
• 群落结构
• 高通量测序
• 微生物多样性

中小学校园是具有人口密度大、微生物传播和交流活跃等特点的特殊人居环境。校园微生物群落组成及其传播是影响青少年健康微生物组形成和发育的重要因素。以某中学校园为研究对象,探究校园不同场所的微生物群落结构,力图初步阐明校园微生物群落及其特征分布。采集教学楼扶手、实验楼扶手门和把手、体育馆扶手、食堂门把手等人体最易接触到的物体微生物样品,采用Illumina HiSeq平台对采集的样品进行细菌16S rRNA基因V4区高通量测序,分析各样品的细菌群落特征。结果显示,不同场所细菌群落存在着不同的特征组成。尽管各场所物体表面的微生物主要属于变形菌门(Proteobacteria),厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)等的栖水菌属(Enhydrobacter),链球菌属(Streptococcus),葡萄球菌(Staphylococcus)等属,但其相对丰度存在着显著的差异。例如,从食堂样品中检测到的丰度较高的不动杆菌属(Acinetobacter)和气球菌属(Aerococcus),在教学区域场所中未发现这两类微生物。体育馆楼梯扶手表面物种多样性显著高于其他场所设施表面物种多样性。通过对校园不同场所细菌组成的初步分析,发现了细菌群落具有按场所用途进行区分的特征,推测这些特征分布应与不同类型教学与生活活动密切相关,为后续研究校园环境对青少年身体健康的影响提供了实践参考。

• 单位
  北京大学; 北京师范大学; 合肥工业大学