茶树SRO基因家族的鉴定及表达分析

作者：郭永春; 王鹏杰; 陈笛; 郑玉成; 陈雪津; 叶乃兴^*

来源：茶叶科学, 2019, 39(04): 392-402.

DOI：10.13305/j.cnki.jts.2019.04.004

• 茶树
• SRO
• 系统进化
• 干旱胁迫

SROs(Similar to rcd one)是植物特有的基因家族。本研究利用生物信息学方法从茶树基因组中鉴定获得9个茶树SRO基因家族成员,分别命名为CsRCD1—4和CsSRO1—5。9个茶树SRO基因的编码蛋白均具有特征结构域PARP和RST,具有相似的保守基序。系统进化树分析聚分为3组,Ι组包含CsRCD1—4,Ⅱ组包含CsSRO1和CsSRO2,Ⅲ组包含CsSRO3—5。基因结构分析表明每个CsSRO基因含有4至9个外显子。8个茶树组织转录组数据分析表明,CsRCD1、CsRCD3和CsRCD4可能在茶树不同发育阶段具有重要作用;大多数CsSRO基因在根和成熟叶中较高表达。上游启动子区域分析发现大量与植物发育、激素及胁迫响应密切相关的顺式作用元件,进一步对CsSRO基因在干旱和脱落酸处理下的表达模式进行分析发现,9个CsSRO基因均被诱导表达,CsSRO基因可能与茶树抗旱密切相关。

• 单位
  福建农林大学