河北邢台一例猪流行性腹泻的确诊及其S1基因序列遗传进化分析

作者：葛生虎; 齐晓亮^*; 张智

来源：养猪, 2021, (06): 89-92.

DOI：10.13257/j.cnki.21-1104/s.2021.06.026

• 猪流行性腹泻
• 病原诊断
• S1基因
• 序列分析

2021年6月初,河北邢台某规模化猪场仔猪发生严重腹泻,发病猪群死亡率超过30%。为确定病因,笔者通过提取发病组织基因组,以real-time PCR及RT-PCR对腹泻病原进行检测与基因测序,最终确定引起仔猪腹泻的病原为PEDV。通过对该病原的S1基因部分序列进行扩增、测序及分析,发现该毒株与国内流行的PEDV变异株同源性较高,核苷酸序列同源性为96.4%～99.2%,但与PEDV传统株的核苷酸序列同源性相对较低,为84.9%～88.3%。遗传进化分析结果表明,该毒株属于G2-a亚型PEDV变异株,且进一步的氨基酸序列比对结果发现,该毒株与当前国内使用的G2型疫苗株AJ1102及其它变异株具有多处相同的氨基酸变异位点,但也出现了诸多独特的氨基酸变异位点。该研究结果表明,导致该场发生仔猪腹泻的病原为PEDV变异株,且其S1基因序列部分氨基酸位点出现了变异,为该场PED的防控提供了科学参考。