紫色马铃薯SPL转录因子家族基因识别

作者：李楠; 马艳红^*; 武小娟; 张志成; 谢锐; 吴娟; 王沛捷; 孟涛; 鲁思琪

来源：分子植物育种, 2023, 1-20.

• 紫色马铃薯
• 转录组测序
• SPL基因家族
• 生物信息学分析

SPL基因是植物特有的一类转录因子，在植物生长发育、次生代谢和生物胁迫等方面都发挥着重要的调节作用。为挖掘紫色马铃薯花青素生物合成及生长发育相关的SPL基因，本研究基于紫色马铃薯不同生育时期块茎的转录组测序数据筛选SPL基因，对其进行理化性质分析、亚细胞定位预测、保守基序分析、进化关系及启动子顺式作用元件分析，并对SPL基因进行功能预测。结果显示，紫色马铃薯中筛选出的29个SPL转录因子，编码的蛋白质大小为64 aa～1 071 aa，分子量分别为7.1 kD～119.0 kD，疏水性为负值，均为亲水蛋白，等电点(pI)介于5.27～9.39之间；25个SPL转录因子均位于细胞核；22个SPL基因具有完整的SBP-box保守结构域，并且推测motif1，motif2，motif3为保守基序；系统进化树将29个SPL转录因子分为8个亚族；启动子顺式作用元件共分析预测出植物生长发育、非生物胁迫及次生代谢等相关元件20种。本研究从基因组及转录组水平上鉴别和分析了马铃薯SPL转录因子家族，为深入研究紫色马铃薯SPL家族转录因子的功能提供参考。

• 单位
  内蒙古农业大学; 内蒙古自治区农牧业科学院