摘要
【目的】ABC1(activity of bc1 complex)是存在于原核及真核生物中的一类蛋白质激酶家族,在植物响应逆境胁迫中发挥重要作用。【方法】为了解谷子基因组中ABC1基因家族的特征及潜在功能,使用HMMER软件对xiaomi基因组中的ABC1家族成员进行鉴定,利用TBtools、MEGA等对谷子ABC1家族基因的染色体分布、基因及蛋白结构、启动子顺式作用元件及亚细胞定位等进行预测,并分析了ABC1家族基因的组织特异性表达模式及响应禾生指梗霉侵染的表达特征。【结果】在xiaomi基因组中共鉴定到谷子ABC1家族基因26个,分布于谷子9条染色体上,编码氨基酸在282~942 aa;系统发育分析表明,谷子ABC1家族成员分为6类,具有8个motif基序,其中motif2和motif3为谷子ABC1家族基因最保守的两段基序;顺式作用元件分析表明,与光响应和激素响应的作用元件最多,不同家族基因在种子、根、茎、叶和穗之间存在组织特异性表达,12个基因在受到禾生指梗霉侵染时表达下调。【结论】在xiaomi基因组中鉴定出同时含有保守域的26个ABC1家族基因,均具有与光响应和脱落酸相关的作用元件,其中定位于叶绿体的SiABC1-5与SiABC1-12基因可能在谷子光合作用中发挥重要作用。
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