苹果Ty1-copia类逆转座子LTR_(10)序列及其在苹果属植物中的遗传多样性分析

作者：孙俊; 房经贵; 王飞; 孙其宝; 章镇; 王昆

来源：南京农业大学学报, 2010, (01): 43-48.

• 苹果
• Ty1-copia类逆转座子LTRs
• 调控元件
• 遗传多样性 apple
• LTRs of Ty1-copia-like retrotransposon
• regulatory elements
• genetic polymorphism

应用改良的Pearce方法分离苹果Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTRs,分离到的RNaseH-LTR_(10)序列已在GenBank注册(登录号DQ534515),该序列长度为299 bp。分析结果表明其5′端为含有终止密码子的RNaseH基因,PPT(polypurinetract)之后是3′-LTR,PPT起始于终止密码子内10 bp处,3′-LTR的起始标志末端倒转重复序列(inverted repeat,IR)TG紧随其后。LTR_(10)的正链和反链均含有多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box,α-淀粉酶启动子的保守序列及受不同胁迫条件作用的调控元件,如...

• 单位
  南京农业大学; 中国农业科学院果树研究所; 安徽农业大学; 安徽省农业科学院园艺研究所