基于microRNA-mRNA相互作用的直肠癌预后标志物的研究

作者：邵梦楠; 郑盛锋; 贡益敏; 韦怡; 张明津; 刘佳艺; 杨小丽^*

来源：广西医科大学学报, 2020, 37(04): 676-682.

DOI：10.16190/j.cnki.45-1211/r.2020.04.020

• 直肠癌
• GEO数据库
• miRNA
• 关键差异基因
• CCND1

目的:通过microRNA-mRNA相结合探讨直肠癌潜在的关键差异基因和预后标志物。方法:从基因表达汇编公共数据库(GEO)获取microRNA芯片数据,分析获得差异表达microRNAs(DE-miRNAs)及其靶基因。对差异基因进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,建立差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,鉴定出关键差异基因,再进一步评估关键差异基因的表达水平和预后作用。结果:总共预测了25个上调和14个下调的DE-miRNAs,对DE-miRNAs的靶基因综合分析后获得了共64个差异基因。共鉴定出10个关键差异基因,GEPIA数据库显示有6个关键差异基因在直肠癌中的表达水平显著高于正常直肠黏膜。经PrognoScan数据库验证,细胞周期蛋白cyclin D1(CCND1)的高表达与结直肠癌较差的预后相关,表达水平和预后的联合分析证明了CCND1的致癌作用。结论:CCND1可能与直肠癌的预后有重要联系,可作为直肠癌预后、药物治疗潜在的新靶点,为后续研究提供新的思路和方向。

• 单位
  桂林医学院; 广西医科大学第一附属医院; 广西医科大学