甜瓜PMEI 基因家族的鉴定和表达分析

作者：陈逸飞; 王文博; 王赛赛; 祝建波^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-24.

• 甜瓜
• PMEI基因家族
• 鉴定
• 表达分析

果胶甲酯酶抑制剂(pectin methylesterase inhibitor， PMEI)基因家族在植物生长发育和果实成熟软化等方面发挥着重要作用。为了探究PMEI基因在甜瓜中存在的形式，本研究利用生物信息学对其基因家族进行分析。通过PMEI基因的蛋白保守结构域，使用HMMER 3.0软件从甜瓜基因组中筛选得到甜瓜PMEI基因。使用MEME和MEGA-X、TBtools等在线软件对蛋白质理化特性、基因结构、系统发育树、启动子分析和表达分析进行相关特征分析。结果表明，在甜瓜基因组中共鉴定出91个成员，分为4个亚家族(A～D)，其成员不均匀分布在12条染色体上，其中11号染色体上分布最多。甜瓜PMEI基因家族的编码区长度为183～1965 bp；氨基酸序列长度为60～654 aa；基因蛋白分子量为6.3～73 kD；蛋白质等电点为3.86～10.61。亚细胞定位结果显示，该家族蛋白主要定位在叶绿体上。此外，PMEI基因也在不同组织中表现出不同的表达模式，大多数基因在花药、雄蕊中有着较高的表达量，而CmPMEI35、CmPMEI47在果实成熟中均高表达。本研究为探究PMEI基因在甜瓜果实软化中的功能提供一定的参考。

• 单位
  生命科学学院; 石河子大学