杜长大猪CIDEa基因克隆及其组织表达分析

作者：罗云彦; 谢红月; 潘鹏; 胡旭旭; 甄锐; 蒋钦杨; 黄艳娜^*

来源：中国畜牧杂志, 2022, 58(01): 108-112.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20210114-01

• 杜长大猪
• CIDEa基因
• 克隆
• 基因表达

本实验旨在克隆杜长大猪(三元杂交猪)诱导细胞凋亡DNA片段化因子45样效应子A(CIDEa)基因序列,通过生物学软件分析CIDEa基因序列,利用实时荧光定量(qPCR)方法检测杜长大猪不同组织中CIDEa基因mRNA的表达量。实验成功获得杜长大猪CIDEa基因CDS区,长度为660 bp,共编码218个氨基酸。杜长大猪CIDEa基因与NCBI已公布野猪、牛、马、犬、人和家鼠的CIDEa基因同源性分别为99.2%、84.8%、81.5%、80.6%、80%、76.1%。与野猪CIDEa基因相比,发生5处碱基突变,分别为第99 C-T、第355 T-C、第609 G-A、第627 C-T,为同义突变,第173 T-C脯氨酸突变为亮氨酸。CIDEa蛋白二级结构预测结果显示,α-螺旋占45.41%,无规则卷曲占33.49%,延伸链占15.14%,β-转角占5.96%;CIDEa蛋白三级结构与二级结构相一致。qPCR结果显示,CIDEa基因在腹脂和皮下脂肪中表达量最高,在肝脏、肾脏、肺脏和心脏中均有表达,在背最长肌中表达量最低。结论表明:CIDEa基因在脂肪沉积中可能起着重要作用。

• 单位
  广西大学