基于全基因组序列分析小西葫芦黄花叶病毒的基因组特征和进化关系（英文）

作者：王德富; 崔丽艳; 王舒婷; 王疆然; 郭尚; 牛颜冰^*

来源：中国生物化学与分子生物学报, 2021, 37(06): 811-821.

DOI：10.13865/j.cnki.cjbmb.2021.03.1626

• 小西葫芦黄花叶病毒
• 系统发育
• 多样性分析
• 选择压

小西葫芦黄花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus, ZYMV)作为葫芦科作物的主要为害病毒之一,严重影响其产量和品质。目前,有关ZYMV遗传进化研究以CP序列为主,而针对全基因组水平系统进化关系研究却少见报道。有鉴于此,本研究以ZYMV山西分离物(ZYMV-WS)和已报道的其他109个ZYMV分离物的全基因组序列为对象,探索其系统进化关系。结果表明,ZYMV-WS分离物的核苷酸与氨基酸分别与ZYMV-SXSG(94.35%)和ZYMV-BR3(97.37%)相似性最高;系统进化分析表明,ZYMV-WS与已报道的109个ZYMV分离物主要分为A和B 2个亚组,种群结构分析表明,A4和B群体之间的遗传变异最大;氨基酸突变与功能分析发现,ZYMV存在与蛋白质功能相关的氨基酸突变。上述结果有助于全面了解ZYMV的遗传多样性和系统进化进程,为今后积极开展ZYMV的有效防控奠定了理论基础。

• 单位
  山西农业大学; 生命科学学院