高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组分析比较

作者：王平; 丛玲; 王春语; 朱振兴; A Ashok Kumar; 张丽霞^*; 陆晓春^*

来源：生物技术通报, 2019, 35(05): 42-47.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0089

• 高粱
• 不育系
• 保持系
• 线粒体基因组
• 细胞质雄性不育

线粒体基因组易位是导致作物细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS)性状产生的重要遗传机制。比较高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组,寻找易位区为克隆高粱A1型细胞质雄性不育相关基因奠定基础。以高粱A1型细胞质雄性不育系Tx623A和其保持系Tx623B为试验材料,采用二代Illumina Hiseq结合三代PacBio测序技术,对2个样品的线粒体基因组进行组装,比较和分析不育系和保持系基因组结构和基因差异。高粱Tx623A和Tx623B线粒体基因组大小分别为449 727 bp和452 772 bp,预测编码开放阅读框(Open reading frame,ORFs)分别为147和145个,且两基因组特有基因分别为8个和6个。两线粒体基因组共线性比较分析,发现存在一个57 kb的基因组片段易位的结构变异(Structural variation,SV)区域,该易位区可能与A1型细胞质雄性不育有关。Tx623A和Tx623B线粒体基因组中易位区为高粱A1型细胞质雄性不育基因克隆提供了基因组信息。

• 单位
  辽宁省农业科学院