北陵鸢尾叶绿体基因组及其特征分析

作者：卢政阳; 于凤扬; 肖月娥; 石钰; 毕晓颖^*

来源：草地学报, 2023, 31(06): 1656-1664.

• 北陵鸢尾
• 鸢尾属
• 叶绿体基因组
• 高通量测序
• 简单重复序列
• 系统发育

本研究为探究北陵鸢尾(Iris typhifolia)叶绿体基因组的基本特征，明确其在鸢尾属的系统发育位置，采用Illumina二代测序技术对北陵鸢尾叶绿体基因组进行测序，对其叶绿体基因组基本特征进行分析，结果表明：北陵鸢尾叶绿体基因组大小为152 405 bp,具有典型的环状四分体结构，包含82 335 bp的大单拷贝区(LSC)、18 018 bp的小单拷贝区(SSC)和一对26 026 bp的反向重复区(IRs),总GC含量为38.04%;共注释得到133个基因，包含87个蛋白编码基因、8个rRNA基因和38个tRNA基因；共检测到57个SSR位点，其中单核苷酸重复数量最多；系统发育分析表明北陵鸢尾和溪荪(I.sanguinea)关系较近，支持率为100%。本研究通过对北陵鸢尾叶绿体基因组重复序列、IR边界、系统发育等进行分析，为北陵鸢尾的分子标记开发、系统发育分析、物种鉴定和种质资源开发及利用提供依据。

• 单位
  沈阳农业大学; 上海植物园