基于ITS序列对青海不同地区中国沙棘遗传变异的分析

作者:**青; 杨开宇; 范文龙; 李长辉; 段勋军; 乔维范; 赵昌宏; 吴有林; 耶芳芳; 马强; 冶贵生; 马玉花*
来源:分子植物育种, 2021, 19(18): 6227-6234.
DOI:10.13271/j.mpb.019.006227

摘要

为研究青海省不同地区中国沙棘的遗传变异,本研究采集青海省不同地区野生的中国沙棘、西藏沙棘和肋果沙棘叶片作为实验材料,提取沙棘叶片的DNA,对其内转录间隔区(ITS)进行PCR扩增和扩增产物测序检测。对中国沙棘的ITS序列进行同源性和差异性分析,以西藏沙棘和肋果沙棘为外类群构建系统发育树。结果表明,不同地区中国沙棘ITS序列的同源性很高,均在99.5%以上。聚类分析结果显示中国沙棘、肋果沙棘和西藏沙棘各自分为一组,与形态学分类中归属于三个不同的种的分类结果一致。11个中国沙棘样品的ITS1区序列长度均为307 bp,5.8S区均为167 bp,ITS2区均为264 bp,3个区域分别存在3个、1个和5个变异位点。说明青海省不同地区中国沙棘的ITS区基因发生了不同程度的变异,本研究为进一步研究沙棘ITS基因提供了理论依据。

  • 单位
    西宁市西山林场; 青海大学农牧学院

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