艾纳香脱氢酶基因家族的生物信息学分析

作者：白琳; 官玲亮^*; 查英; 于福来; 王凯; 谢小丽; 庞玉新; 陈松笔^*

来源：热带作物学报, 2020, 41(06): 1145-1153.

DOI：10.3969/j.issn.1000-2561.2020.06.011

• 艾纳香
• 艾纳香脱氢酶(BbADH)
• 氨基酸序列
• 保守区
• 系统发育分析

采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera (L.) DC.)叶片中克隆到4条编码艾纳香脱氢酶(BbADH1、BbADH2、BbADH3、BbADH4)基因的cDNA序列,并对4条核苷酸及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析。结果显示:4条艾纳香脱氢酶序列开放阅读框均在900bp左右,蛋白质等电点(pI)值在5.0～9.0之间,含量最多的氨基酸为亮氨酸(Leu),最少的为色氨酸(Try),具有明显的疏水区和亲水区,N端未发现信号肽,且无跨膜区;同源性比对结果显示,艾纳香BbADH蛋白与其他植物中ADH蛋白具有高度的相似性,且具有脱氢酶的特征功能域;系统发育分析表明,艾纳香(B. balsamifera (L.) DC.)BbADH1和BbADH3同处于一个分支,且与胡杨(Populus euphratica Oliv.)PeADH物种亲缘关系较近,而艾纳香BbADH4和BbADH2处于不同分支,且分别与葡萄(Vitis vinifera)VvADH和烟草(Nicotiana tabacum)NtADH物种亲缘关系较近。

• 单位
  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所; 黑龙江八一农垦大学