前列腺癌相关基因、癌组织差异表达基因及预后相关基因筛选

作者：梅玉洁; 赛麦提喀日·阿布都巴日; 安恒庆; 陶宁^*

来源：山东医药, 2022, 62(15): 12-16.

• 前列腺癌相关基因
• 前列腺癌差异表达基因
• 预后相关基因
• 前列腺癌

目的 筛选前列腺癌（PCa）相关基因、癌组织关键差异表达基因和预后相关基因，为PCa患者提供新的研究靶点。方法 选择GEO数据库中GSE104131数据集，对PCa组织基因进行加权基因共表达网络分析（WGCNA），获得与PCa组织相关性最高的关键基因模块及与关键基因模块、PCa均高度相关的关键基因，然后对关键基因模块进行信号通路富集分析。基于GSE69223、GSE104131数据集，比较PCa组织及正常癌旁组组中的关键基因表达水平，筛选有统计学差异的关键基因（关键差异表达基因）。最后基于GEPIA2数据库，对不同关键差异表达基因水平的PCa患者进行生存分析，筛选与PCa预后相关的基因。结果 WGCNA分析获得棕色模块为关键基因模块，其主要富集于内质网中的蛋白质加工通路；关键基因有14个，分别是P4HB、ERGIC1、FOXA1、RP11-498C9.2、HNRNPF、CANT1、SYNGR2、HID1、EIF2AK1、MARCKSL1、NME1、ST14、HPN、RAB3D；与正常癌旁组织比较，关键基因在PCa组织中表达水平均高（P<0.05）,14个关键基因均为关键差异表达基因。P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2高表达较低表达的患者DFS更长，HNRNPF低表达患者较高表达的患者OS更长（P<0.05）。P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2、HNRNPF为PCa预后相关基因。结论 PCa相关基因、癌组织关键差异表达基因均为14个，其中P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2及HNRNPF为PCa预后相关基因。

• 单位
  新疆医科大学; 新疆医科大学第一附属医院; 公共卫生学院