猪瘟脾淋苗免疫仔猪9 d外周血细胞转录谱分析

作者：包松英

来源：福建畜牧兽医, 2022, 44(05): 31-36.

• 猪瘟脾淋苗
• 仔猪
• 外周血
• RNA-seq

目的：分析猪瘟脾淋苗免疫仔猪9 d的外周血细胞转录组数据，完善猪瘟脾淋苗免疫机理研究。方法：采集免疫猪瘟脾淋苗9 d小猪（5头）的外周血细胞进行转录组测序分析，并以脾淋组织免疫为对照（5头）。结果：猪瘟脾淋苗组与脾淋组织对照组相比，差异表达的基因（Differentially Expressed Genes,DEGs）有17 382个，显著差异的DEGs有605个（P<0.05），其中上调的有294个，下调的有311个；将DEGs进行基因本体论（Gene Ontology,GO）功能富集分析，发现免疫后9 d，富集的条目有1 044个，与生物过程相关的有749个，其中酰胺生物合成过程、细胞酰胺代谢过程、翻译等23个过程显著富集（Q<0.05）；与细胞组分相关的有145个，其中胞质核糖体、核糖体亚基、核糖体等15个组分显著富集（Q<0.05）；与分子功能相关的有150个，核糖体结构成分、结构分子活性、RNA结合3个功能显著富集（Q<0.05）;DEGs在京都基因与基因组数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）中富集的信号通路数量有263个，差异显著的通路有10个（P<0.05），包含核糖体、生热作用、一磷酸腺苷活化蛋白激酶信号通路等。结论：本研究提供了猪瘟脾淋苗免疫仔猪9 d的外周血细胞转录组谱，猪瘟脾淋苗可激活外周血细胞核糖体等信号通路，促进蛋白质生物合成。