核转录因子NFYB和NFYC促进红系终末分化

作者：余东林; 杨希; 阴佳滢; 刘雪会^*; 吕湘^*

来源：基础医学与临床, 2022, 42(06): 920-926.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2022.06.006

• NFYB
• NFYC
• SCENIC
• 红系终末分化

目的 利用单细胞转录组数据分析挖掘红系终末分化的潜在转录因子，并重点对预测得到的核转录因子NFYB和NFYC在红系终末分化中的表达和功能进行探究。方法 使用人骨髓红系终末分化单细胞转录组数据，结合SCENIC分析预测分化阶段特异性转录调控因子。利用公共测序数据集重点分析预测出的NFYB和NFYC在人与小鼠红系终末分化不同阶段中的表达；荧光激活细胞分选技术(FACS)分选小鼠胎肝体外红系终末分化各阶段的细胞，检测Nfyb和Nfyc的表达水平。在小鼠胎肝红系分化体系中使用慢病毒感染，分别敲低Nfyb和Nfyc,检测红系终末分化及脱核的变化。结果 通过SCENIC分析预测出NFYB和NFYC是红系终末分化早期的调控因子，在人与小鼠的红系终末分化早期表达较高，晚期则降低。在小鼠胎肝体外红系分化体系中分别敲低Nfyb和Nfyc,均可显著抑制红系终末分化(P<0.05)及脱核(P<0.05)。结论 NFYB和NFYC促进红系终末分化过程。

• 单位
  中国医学科学院基础医学研究所; 北京协和医学院; 医学分子生物学国家重点实验室