文章从地形地质条件、水工布置、施工条件、运行管理及工程造价等方面对乌斯通沟水库坝线和枢纽布置进行了比选,分析了两种坝线、枢纽布置的设计方案及影响因素,经比较,上坝线和沥青混凝土心墙砂砾石坝左岸灌溉洞方案投资较低,能有效地避免高边坡开挖及处理,大幅降低施工难度,因此,选择上坝线为乌斯通沟水库坝线,选择沥青混凝土心墙砂砾石坝左岸灌溉洞方案为最优枢纽布置方案。研究成果可为南疆地区其他水利枢纽方案比选提供参考。