烟草NtMYB102转录因子基因克隆及生物信息学分析

作者:平文丽; 孙计平; 郭梅燕; 孙焕; 张雪珂; 李雪君*
来源:烟草科技, 2023, 56(11): 16-23.
DOI:10.16135/j.issn1002-0861.2023.0477

摘要

为解析NtMYB102转录因子的结构并预测其功能,采用同源克隆和Sanger测序法,从烟草品种K326中获得NtMYB102基因的CDS序列,基于该序列分析NtMYB102基因编码蛋白的理化性质、结构域和基因上游顺式作用元件。从NCBI SRA数据库中下载烟草接种青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)后的转录组原始数据,分析NtMYB102基因的表达量变化,并采用实时荧光定量PCR法分析烟草接种蚜虫后NtMYB102基因的相对表达量变化。结果表明:(1)NtMYB102基因全长1 131 bp,编码的NtMYB102蛋白由376个氨基酸组成,具有典型的MYB特征结构域,是一个无信号肽、无跨膜结构、具有磷酸化位点的亲水蛋白。(2)NtMYB102基因上游2 000 bp有多个与逆境胁迫、病原响应相关的调控元件。(3)抗烟草青枯病品种岩烟97接种青枯雷尔氏菌后36 h,NtMYB102基因表达量显著低于0 h,表明该基因可能在烟草响应青枯雷尔氏菌的侵染中起调控作用。(4)接种蚜虫后,烟草品种中烟100 NtMYB102基因的相对表达量显著提高,表明该基因可能参与烟草对蚜虫取食的响应。

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