菠萝PEPC基因家族生物信息学分析

作者：马海洋; 赵秋芳^*; 陈曙; 石伟琦; 冼皑敏

来源：热带作物学报, 2020, 41(01): 97-103.

DOI：10.3969/j.issn.1000-2561.2020.01.014

• 菠萝
• 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)
• 基因进化
• 基因表达谱

磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC)在C4和景天酸代谢(CAM)光合途径吸收CO2过程中发挥重要作用,并参与各种非光合作用过程,包括果实成熟、气孔开放、碳氮相互作用、种子形成和萌发以及调节植物对逆境胁迫的耐受性。菠萝为典型的景天酸代谢途径(CAM)植物,为了解磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)在菠萝景天酸代谢途径(CAM)中的作用,本研究鉴定到3个菠萝PEPC基因,按照基因描述命名为AcPEPC1、AcPEPC3和AcPEPC4,进化树分析结果 AcPEPC1和AcPEPC3为植物型PEPC(PTPCs)蛋白,序列同源性较高且基因结构、保守结构域及保守基序均一致。AcPEPC4为细菌型PEPC(BTPCs)蛋白,与AcPEPC1/AcPEPC3间的序列同源性低。组织表达分析表明AcPEPC1菠萝叶片表达量较高,而AcPEPC3和AcPEPC4在菠萝花和果实表达量较高。

• 单位
  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所; 海南省热带作物营养重点实验室