东莞市2014年手足口病病原检测与基因特征分析

作者：李艳芬; 黄勇; 黎景全; 袁达康; 陈永迪; 曾汉日

来源：中国热带医学, 2015, 15(11): 1306-1311.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2015.11.06

• 手足口病
• 肠道病毒71型
• 柯萨奇病毒A16型
• 衣壳蛋白VP1
• 基因特征

目的对东莞市2014年手足口病(HFMD)疑似病例样本进行病原学检测,并对引起HFMD的肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)进行基因特征分析,为东莞市HFMD的防控提供基础资料。方法采用Real timeRT-PCR(实时荧光PCR)方法对HFMD疑似病例样本进行检测,核酸阳性样本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,基因扩增并测定VP1基因序列。从Gen Bank中选取EV71和CA16不同基因型参考毒株,利用DNA-STAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0.2软件构建亲缘性进化树。结果共检测HFMD疑似病例样本693份,核酸阳性结果614份,总阳性率为88.60%。其中EV71阳性结果241份,占39.25%,CA16阳性194份,占31.60%,其他肠道病毒(EV)179份,占29.15%。共获得11株EV71分离株和8株CA16分离株的VP1基因全长序列。11株EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.3%100.0%和98.3%100.0%,8株CA16分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89.9%100.0%和99.3%100.0%。系统进化树分析显示,11株EV71全部属于C4a基因亚型;8株CA16分离株中有6株属于B1b基因亚型,2株属于B1a基因亚型。结论 2014年引起东莞市HFMD的EV71型病毒流行株为C4a基因亚型,CA16型病毒流行株B1a和B1b亚型并存,并兼有一定比例的其他肠道病毒。

• 单位
  东莞市疾病预防控制中心; 广东省疾病预防控制中心