小鼠死后环状RNA的降解规律及其用于死亡时间推断的适用性

作者:郝尔娃; 吴岳*; 杨应忠; 马启宁; 赵洪乾; 于聪
来源:中国高原医学与生物学杂志, 2019, 40(02): 105-109.
DOI:10.13452/j.cnki.jqmc.2019.02.005

摘要

目的探讨小鼠小脑组织3种circRNA的降解规律,及其用于死亡时间推断的适用性。方法应用转录组学方法设计课题。将50只小鼠随机分为两个大组(4℃恒温箱组和20℃恒温箱组),用断颈法处死,每个大组小鼠按照死亡时间分为5个小组(死后0、24、48、96、168h组,每小组5只),其中0 h组为对照组。取小鼠小脑组织,利用实时荧光定量PCR技术对β-actin,CDR1as circRNA,Rims2 circRNA及Dym circRNA的表达水平进行检测,使用SPSS19.0软件进行数据分析。结果 CDR1as circRNA的M值在四组候选内参基因中最小,等于0.417;Rims2 circRNA与Dym circRNA的表达量随着死亡时间增加而呈现递减趋势(P<0.05);4℃组Rims2 circRNA与Dym circRNA的三次回归模型的回归系数r2最大(回归方程分别为■;■;20℃组Rims2 circRNA与Dym circRNA的三次回归模型的回归系数较大(回归方程分别为■;■。结论小鼠小脑组织3种circRNA的降解规律:CDR1as circRNA适合作为本实验中的内参基因;Rims2 circRNA与Dym circRNA的表达量随着死亡时间增加而呈递减趋势(P<0.05);Rims2 circRNA及Dym circRNA的相对表达量受PMI影响较大(P<0.05);4℃条件下相对于20℃条件下的PMI对circRNA相对表达量的影响更大。

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