中药成分复杂且有些生物活性成分不明确,有些中药的作用机制尚不明确,使得中医药在世界范围内的推广和应用仍存在较大障碍。目前,肠道菌群是了解口服中药制剂发挥作用的新领域。中药可以调节肠道菌群,促进有益菌生长,而且可以调节肠道菌群的分泌物;同时,肠道菌群能转化中药化合物并使其更易吸收,减轻中药毒副作用。本文从肠道菌群与机体健康、肠道菌群与中药之间的相互作用关系、代谢物作用等多个方面进行综述,以期为进一步研究中药作用机制和合理开发提供理论基础和参考。