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摘要
云南芥菜型油菜种质资源丰富，为整理前人搜集的275份芥菜型油菜种质材料亲缘关系与评估电子PCR技术(e-PCR)的实用性，本研究利用搜集的17 713对公开发表的芸薹属作物SSR标记在芥菜型油菜参考基因组和cDNA序列中进行e-PCR分析后挑选引物进行群体PCR分析。e-PCR分析结果显示8 016对预期有扩增产物，共计扩增37 272个位点，平均每对引物扩增4.65个位点；其中336对引物在基因组与cDNA序列均预期扩增2个位点。从336对引物中随机挑选合成20对预期扩增位点覆盖全基因组的SSR标记组合进行群体分析，PCR电泳结果共检测出63个条带，每对引物多态性片段为2～5个，平均每对引物可扩增3.15个条带；标记PIC值变化范围0.03～0.69，平均PIC值0.45，结果符合e-PCR分析预期。群体遗传聚类分析结果表明，云南芥菜型油菜的亲缘关系并不完全与地域性相关，少数来源不同地区的材料也可聚成一类；275份材料可在遗传相似系数为0.70处被划分为八大类群，95份原始记录信息缺失的种质材料大多位于第Ⅷ大类。本研究同时从分子标记层面理清了275份芥菜型油菜种质材料亲缘关系，验证了e-PCR分析结果的有效性，并绘制扩增芥菜型油菜基因内部序列的SSR标记图谱，这将为芥菜型油菜种质资源评价，保护及后续育种利用提供有力的理论依据与技术支持。
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单位西南林业大学; 云南省农业科学院经济作物研究所
