白菜亚硝酸还原酶基因BcNiR的克隆及表达分析

作者：孙菲菲; 蒋芳玲; 侯喜林; 李英; 杨学东

来源：园艺学报, 2009, (10): 1511-1518.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2009.10.018

• 白菜
• 亚硝酸还原酶
• 克隆
• 基因表达 Brassica campestris L.ssp.chinensis(L.)Makino
• NiR gene
• cDNA
• cloning
• expression

以白菜品种‘苏州青’自交系叶片cDNA为模板,采用RT-PCR、3′RACE和5′RACE技术,获得了编码亚硝酸还原酶基因(NiR)的cDNA全序列1852bp,包含有1749bp的开放阅读框,编码583个氨基酸,命名为BcNiR。所推导的氨基酸序列与拟南芥NiR1、烟草nii2编码的氨基酸序列具有较高同源性,分别为83%和76%。生物信息学分析表明,BcNiR具有完整的NiR蛋白结构,含血红素蛋白β-化合物区域,一个明显的西罗血红素siroheme结合位点和4Fe-4S区域,可以在SWiSS-MODEL数据库中搜索到与之相近的三维结构。RT-PCR结果显示,该基因在叶片中的表达量远远高于根系...

• 单位
  农业部; 作物遗传与种质创新国家重点实验室; 南京农业大学