乙醛脱氢酶ALDH4A1的生物信息学分析

作者：贺继平; 陈晓聪; 苏晓云; 门杰^*; 邹双玲

来源：智慧健康, 2022, 8(08): 180-185.

DOI：10.19335/j.cnki.2096-1219.2022.08.054

• 动脉粥状硬化
• ALDH1A1蛋白
• 生物信息学

目的 研究乙醛脱氢酶1A1（ALDH1A1）蛋白的结构与功能，进一步探究其在动脉粥状硬化发生发展及临床病理因素的关系。方法 利用Protparam、ProtScale、NetPhos3.1、YinOYang 1.2 Server、NetNGlyc 1.0Server、SOPMA及SWISS-MODEL等在线软件和生物信息学手段对ALDH1A1蛋白的理化性质、亲疏水性、磷酸化位点、糖基化位点及二、三级结构等生物学特性进行了系统分析，并利用Clustal×2和MEGA7.0软件对ALDH1A1蛋白进行同源性分析和系统进化分析。结果 ALDH1A1蛋白由563个氨基酸组成，是亲水碱性蛋白，不稳定指数为41.65；在体外哺乳动物中的半衰期为30h；共有44个可能的磷酸化位点和8个可能的糖基化位点；无跨膜螺旋区与信号肽；二级结构预测结果显示，ALDH1A1蛋白中α-螺旋结构与无规则卷曲结构占比都较高，而β-转角结构占比很少，只有4.97%；同源性与进化性分析显示，与褐家鼠序列一致性最高的是黄金仓鼠，它们的亲缘关系最近。结论 ALDH4A1进化性高度保守功能重要，有助于揭示蛋白功能、靶向药物设计，有助于动脉粥样硬化治疗提供理论参考。

• 单位
  山西医科大学汾阳学院