基于RNA-Seq鉴定不同石榴品种间果实糖酸代谢基因

作者：冯立娟; 付莹; 王传增; 杨雪梅; 尹燕雷^*; 陶吉寒

来源：植物生理学报, 2022, 58(06): 1161-1172.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2020.0553

• 石榴
• 转录组
• 糖酸代谢
• 差异基因
• 表达模式

糖酸组分与含量是影响石榴果实品质的重要指标,研究其代谢机理能为石榴品质改良提供理论依据。本研究用Illumina高通量测序技术比较分析了石榴‘泰山红’和‘牡丹’成熟期的转录组数据,对糖酸代谢相关基因进行了鉴定和表达分析。结果表明,共获得51 670个差异表达基因,其中显著差异表达基因2 409个,不显著差异表达基因40 101个。在GO数据库中, 7 502个差异基因被注释到3个类别46个亚类中,主要参与代谢过程和细胞过程。在KEGG代谢通路中, 257个差异基因参与了19个代谢通路,代谢途径和次生代谢物生物合成途径得到显著富集。通过生物信息学分析,挖掘出参与石榴果实糖酸代谢的关键基因17个。qRT-PCR分析表明, 2个石榴品种中TK基因的表达量最高,存在品种差异性。‘泰山红’中FRK、SS、BGLU、UXS、FBA和ADH的表达量高于‘牡丹’。石榴果实中,葡萄糖和果糖是主要的糖组分,酸以柠檬酸和苹果酸为主。

• 单位
  山东省果树研究所; 山东省农业科学院