摘要
目的 探讨食管鳞状细胞癌与胃腺癌共同致病机制。方法 我们使用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)鉴定出食管鳞状细胞癌和胃腺癌的共同差异表达基因,并通过功能富集分析,蛋白互作网络(PPI网络)及转录因子调控网络的构建进一步揭示共同致病基因的生物学特征。结果 89个共同上调差异基因和27个共同下调差异基因构成一个PPI网络,然后筛选前15个核心基因。在删除验证组中无统计学意义的基因后得到12个核心基因,分别是:UBE2C,CXCL8,SPARC,COL1A1,COL1A2,KIF20A,COL3A1,TPX2,THBS1,COL5A1,COL4A1,SERPINH1。本研究继续对基因的转录因子进行富集分析并验证,然后构建转录因子靶基因调控网络。3个转录因子(HDAC2,NFKB1,RELA)调控3个核心基因(CXCL8,COL1A2,COL1A1)的网络分析进一步阐明了食管鳞状细胞癌与胃腺癌的共同致病途径。结论 本研究发现3个转录因子调控3个核心基因的共同致病基因网络。这与食管鳞状细胞癌和胃腺癌共同致病机制高度有关。其中HDAC2转录因子通过调控CXCL8,COL1A2基因参与共同致病过程,NFKB1,RELA转录因子通过调控CXCL8,COL1A2,COL1A1基因参与共同致病途径,CXCL8,COL1A2,COL1A1基因可能是食管鳞状细胞癌和胃腺癌双原发癌患者潜在的治疗靶点。
-
单位安徽医科大学第二附属医院