基于生物信息学分析乌司奴单抗治疗寻常型银屑病不应答的关键基因和信号通路

作者：王利霞; 甘泉; 甘才斌; 夏永华^*

来源：实用药物与临床, 2023, 26(06): 494-499.

DOI：10.14053/j.cnki.ppcr.202306003

• 寻常型银屑病
• 乌司奴单抗
• 生物信息学
• 差异基因
• 富集分析

目的 应用生物信息学技术寻找乌司奴单抗治疗寻常型银屑病无应答患者中的差异表达基因，分析信号通路，探讨不应答机制。方法 在Gene Expression Omnibus (GEO)下载GSE117239数据库。以P<0.05及|logFC|≥1.5为标准筛选表达差异基因。通过String数据库进行蛋白互作网络(PPI)分析，使用Cytoscape的cytohubba插件提取关键目标和子网络。使用Funrich对表达差异基因进行GO分析，最后使用ConsensusPathDB数据库进行KEGG pathway分析。结果 发现76个差异基因，其中上调基因48个，下调基因28个。GO分析显示上调基因主要富集的生物过程为细胞定位、免疫效应过程、细胞组分生物合成、细胞活化、细胞死亡。下调基因主要富集的生物过程为调节血液循环、血管生成、血管发育以及组织迁移等。KEGG分析显示差异基因主要富集的信号通路为：核糖体、凋亡、多糖降解、溶酶体等信号通路。PPI网络分析出的10个枢纽基因为：CCL20、CXCL9、S100A9、S100A12、ARG1、OAS1、OASL、IL36G、SERPINB4、KRT16。结论 CCL20、CXCL9、S100A9等基因可能在乌司奴单抗治疗寻常型银屑病不应答中发挥关键作用。

• 单位
  新乡医学院; 新乡医学院第一附属医院; 新乡市中心医院