牛种间UTY基因内含子19(UTY19)序列遗传变异研究

作者：杨秋蕾; 马志杰^*; 李广祯; 陈生梅; 李文浩; 杨永清

来源：青海畜牧兽医杂志, 2020, 50(06): 7-14.

• 牛
• Y染色体
• UTY19
• 遗传变异
• 系统发育

为分析UTY基因内含子19(UTY19)序列在牛亚科牛种间的遗传变异,探究其是否适用于构建牛种间的系统发育关系,本研究对106头柴达木黄牛该基因片段进行测序和多态性检测,从GenBank中下载牦牛、瘤牛、美洲野牛、印度野牛和水牛的UTY19相应序列,进行牛种间序列比对分析,并构建牛种间系统发育树以揭示其亲缘关系。结果表明,得到的柴达木黄牛(普通牛)UTY19核苷酸序列长度为280 bp,在其内部检测到1处多态位点(即A25C);不同牛种UTY19核苷酸序列间共检测到7处转换(即C30T、A61G、T65C、T98C、C101T、T180C和C276T)、3处颠换(即A3T、C33A和C212A)和1处10 bp的核苷酸序列串(AATACCAAAT)的插入/缺失。基于该序列使用最大似然法(ML)构建的系统进化树聚类结果显示,普通牛(柴达木黄牛)与瘤牛先聚为一类,后与印度野牛聚为一个分支,而牦牛与美洲野牛先聚为一类,后与水牛形成另一个分支,最后2个分支再聚在一起,表明该聚类结果与牛种间传统分类及其他研究结果不完全一致。综上所述,UTY19在牛亚科普通牛(柴达木黄牛)种内及各牛种间存在丰富的遗传变异,但该基因序列片段不适合于构建牛种间系统发育关系。

• 单位
  青海大学