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摘要
目的 探讨肝癌(HCC)环状RNA(circRNA)竞争性内源RNA(ceRNA)分子机制及其关联信号通路。方法 共收集10对HCC及癌旁组织,应用circRNA芯片检测其中4对HCC及癌旁组织,对circRNA芯片数据进行聚类分析,结合生物信息分析的结果筛选出目标circRNA并用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证；基于公开的同类型测序数据库,采用Cytoscape软件构建微小RNA(miRNA,miR)-Target-Network、miRNA-Gene-Act-Network,分析与目标circRNA关联密切的信号通路；通过免疫组织化学方法验证信号通路的关键蛋白。结果 肝癌及癌旁组织RNA提取及质检合格,环状RNA芯片检测肝癌及癌旁组织circRNA,图像清晰可见、扫描数据可靠；通过聚类分析及RT-qPCR验证结果获得circRNA100338为候选靶标,吸附miR-141-3p,HCC中circRNA100338水平(0.012±0.007)高于癌旁circRNA100338水平(0.005±0.003)(P<0.05),HCC中miR-141-3p水平(0.885±0.354)低于癌旁miR-141-3p水平(4.066±1.628)(P<0.01)；基于我们的芯片数据,联合同类型测序数据库(GSE25599、GSE77276)分析结果显示,miR-141-3p与RHEB的mRNA表达水平的负相关性值为－0.602,circRNA100338与RHEB显著正相关(Correlation test,P<0.05),推断circRNA100338/miR-141-3p调控PI3K/AKT/mTOR信号通路；免疫组化结果显示该信号通路关键蛋白RHEB在circRNA100338高表达(circRNA100338/GAPDH > 0.05)的HCC组织中表达增强(评分≥ 3),与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论 肝癌circRNA100338/miR-141-3p轴参与调控PI3K/Akt/mTOR信号通路,RHEB蛋白表达强度与circRNA100338水平明显相关。
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