成都市猫诺如病毒的检测及VP1基因序列分析

作者：黄思琦; 黄坚; 杨晓农; 郭琪; 李妍^*

来源：动物医学进展, 2021, 42(01): 25-32.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2021.01.005

• 猫诺如病毒
• 病毒性腹泻
• 反转录-聚合酶链反应
• VP1基因

为了解四川成都市猫诺如病毒(FNoV)的感染情况,应用公开报道的3对PCR引物对127份临床采集的猫粪便样本(含临床腹泻样本71例,临床健康样本56例)进行FNoV核酸检测,并根据病毒基因片段序列构建遗传进化树。结果显示,采用猫诺如病毒特异性引物FNoV-F9/R15的检出率为9.45%(12/127),高于采用杯状病毒广泛性引物p289d-p290d(2.36%,3/127)及诺如病毒特异性引物JV12Y/13I的检出率(0.79%,1/127)。检测发现在临床阳性样本中存在猫泛白细胞减少症病毒(FPV)、猫肠道冠状病毒(FECoV)和猫星状病毒(FAstV)的混合感染。12株临床阳性样本病毒的RNA聚合酶基因序列分析显示,它们与GenBank上提交的猫诺如病毒及狮子诺如病毒处于同一分支,证实为猫诺如病毒。基于VP1基因序列分析结果显示,临床毒株间核苷酸同源性为89.0%～100.0%,氨基酸同源性为96.5%～100%,均位于诺如病毒GⅣ.2分支。临床毒株可分为2个分支,其中4株与日本毒株(GenBank登录号:LC389583)、美国毒株(GenBank登录号:JF781268)关系紧密;而另外3株则独立聚为1个分支,并存在共有的氨基酸变异位点。结果表明,成都市猫群中存在FNoV的流行,并与其他猫肠道病毒呈现混合感染。采用引物FNoV-F9/R15检测灵敏度高,适用于FNoV的临床检测。由于FNoV基因不断变异,存在临床发病风险,需要对其进行持续监测。

• 单位
  西南民族大学