猪δ冠状病毒核衣壳蛋白互作的蛋白鉴定及分析

作者：张钧彦; 贺微; 粟硕^*

来源：病毒学报, 2021, 37(04): 900-909.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004014

• 猪δ冠状病毒
• 核衣壳蛋白
• 免疫共沉淀
• 质谱
• 互作蛋白

初步筛选与鉴定PDCoV N蛋白的宿主互作蛋白。利用免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,CO-IP)和LCMS/MS质谱技术筛选出PDCoV N蛋白的宿主互作蛋白,并进行生物信息学分析,再利用免疫共沉淀进行鉴定。通过免疫共沉淀产物的SDS-PAGE分析发现在40 kD和100 kD左右有明显的差异蛋白条带,通过质谱筛选到了68个与PDCoV N蛋白互作的宿主蛋白,并做了GO、COG和KEGG注释,挑选出2个候选互作蛋白,经过免疫共沉淀验证,PDCoV N蛋白与TUBB2B存在互作关系。该研究为进一步探索PDCoV N蛋白在病毒感染细胞时的作用提供了新方向。

• 单位
  南京农业大学