基于网络药理学与分子对接探讨藿香防治新型冠状病毒肺炎的分子机制

作者:周文静; 张萌; 闫宇晨; 王珊珊; 彭涛; 李艳彦; 柴智*
来源:实用中医内科杂志, 2020, 34(09): 1-122.
DOI:10.13729/j.issn.1671-7813.z20200366

摘要

目的采用网络药理学与分子对接方法研究藿香防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子机制。方法运用TCMSP数据库获得藿香有效成分及作用靶点;从OMIM、Pharm GKB、Gene Cards、TTD数据库收集疾病靶点,利用Cytoscape软件构建"中药-成分-靶点"网络;将所有靶点输入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,利用DAVID数据库对核心靶点进行GO富集和KEGG通路富集分析。将主要化合物分别与2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶和关键靶点进行分子对接。结果筛选出藿香有效化学成分16个,藿香防治COVID-19的关键靶点为TNF、IL6、GAPDH、CXCL8、PTPRC、MAPK3、IFNG、CCL2、CASP3、PTGS2,主要通过Toll、NOD、RIG-I样受体信号通路,MAPK信号通路,T细胞受体信号通路,朊病毒性疾病等途径发挥作用。分子对接结果显示藿香中槲皮素、芫花素、槲皮素-7-O-β-D-葡糖苷等化合物与2019-nCoV 3CL水解酶的结合能较低。结论明确了藿香防治COVID-19的物质基础与分子机制,为中药对抗COVID-19提供了理论支撑和科学借鉴。

  • 单位
    山西省中西医结合医院; 山西中医药大学; 基础医学院

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