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摘要
目的 探讨核糖体蛋白L4(RPL4)在结直肠癌患者中的预后价值及生物学意义。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载542例结直肠癌患者的转录组数据和417例具有完整的总生存期和生存状态资料患者的临床数据。经limma差异基因分析，比较RPL4在结直肠癌组织和正常组织的表达情况，并采用Kaplan-Meier生存分析，评估RPL4表达与结直肠癌患者预后的关系。采用TISCH数据库在单细胞测序水平上验证RPL4在肿瘤微环境中表达的主要细胞类型。经GSEA富集分析探究RPL4表达水平上调相关的肿瘤特征情况。采用Cell Miner数据库中癌NCI-60细胞系抗癌药物测试数据，探讨与RPL4基因相关药物的药物敏感性分析。采用HPA数据库和实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)实验分别对组织中RPL4蛋白和mRNA的表达水平进行验证。结果 在TCGA结直肠癌的转录组数据中，结直肠癌组织样本中RPL4的表达水平明显高于正常组织，差异有统计学意义(P<0.001)。经患者配对差异分析发现，结直肠癌组织样本中RPL4的表达水平大多高于正常组织。经Kaplan-Meier生存分析发现，RPL4低表达组的总生存期明显长于高表达组，差异有统计学意义(P<0.05)。在单细胞测序水平分析中，RPL4主要在恶性细胞和大多数免疫细胞高表达，而在上皮细胞几乎不表达。经GSEA富集分析发现，在Hallmark基因集中，主要富集于MYC和氧化磷酸化通路；在KEGG基因集中，主要富集于细胞周期和DNA复制以及氨基酸代谢相关通路，这些通路主要参与调控肿瘤的增殖与分化。药物敏感性分析发现，贝利司他、帕博西尼和小分子XR-11576等8种药物的IC50值在RPL4高表达组中显著降低，差异有统计学意义(P<0.05)。在HPA数据库中，RPL4在结直肠癌组织的蛋白表达水平明显高于正常组织。经实时荧光定量PCR实验验证，在结直肠癌组织中，RPL4的mRNA表达水平明显高于正常组织，差异有统计学意义(P<0.05)。结论 核糖体基因RPL4有潜力成为用于结直肠癌诊断和预后评估的新型生物学标志物。
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单位沈阳医学院
