摘要
为探究海马齿SAP基因家族及其分析表达,通过生物信息学方法调取海马齿SAP蛋白家族序列进行了生物信息学分析包括多序列比对、预测蛋白质理化性质、系统进化树、蛋白保守基序。将400 mmol/L Nacl盐胁迫以及25 mg/L镉胁迫处理好的样本拆分成地上部分和地下部分放入干冰中送往北京诺禾致源科技股份有限公司进行转录组测序分析,用作SAP基因家族分析的参考。通过PacBio测序平台对海马齿进行全长转录组测序,利用转录组数据对生物信息学分析进行验证。选取转录组数据中表达量较好的成员,进行后续实时定量的实验验证其功能性及表达量。本研究为进一步研究海马齿SAP家族的生物学功能提供依据,同时挖掘相关耐受基因对提高植物耐受性有很大帮助。
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单位海南师范大学; 生命科学学院