本发明公开了一种小分子DNA纯化试剂,由试剂A和试剂B两种独立的试剂构成,其中,其中试剂A为饱和碘化钠水溶液(pH 6.0),且其中含有0.5%质量浓度的Na2SO3,试剂B为DNA洗涤液,配方为20mM pH 7.2的Tris.HCl、50mM KCl、85%乙醇。本发明的DNA纯化试剂可同时替代PCR产物纯化试剂盒和DNA胶抽提试剂盒中的试剂纯化DNA或从琼脂糖凝胶中抽提DNA,特别是对小分子DNA具有很好的纯化效果,具有很大应用价值和市场前景。